Cara Instal blasr di Debian 11
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal blasr di Debian 11. blasr memetakan pembacaan urutan molekul tunggal
pengantar
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal blasr di Debian 11.
Apa itu blasr
Penyelarasan lokal dasar dengan penyempurnaan berurutan (BLASR) adalah metode untuk memetakan pembacaan sekuensing molekul tunggal terhadap genom referensi. Pembacaan semacam itu memiliki panjang ribuan basa, dengan perbedaan di antara mereka dan genom yang didominasi oleh error penyisipan dan penghapusan.
Ada tiga cara untuk menginstal blasr di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.
Instal blasr Menggunakan apt-get
Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.
sudo apt-get update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal blasr menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt-get -y install blasr
Instal blasr Menggunakan apt
Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal blasr menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt -y install blasr
Instal blasr Menggunakan aptitude
Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal blasr menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:
sudo aptitude -y install blasr
Cara Menghapus blasr di Debian 11
Untuk meng-uninstall hanya paket blasr kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get remove blasr
Copot pemasangan blasr Dan Dependensinya
Untuk meng-uninstall blasr dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:
sudo apt-get -y autoremove blasr
Hapus Konfigurasi dan Data blasr
Untuk menghapus konfigurasi dan data blasr dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y purge blasr
Hapus konfigurasi blasr, data, dan semua dependensinya
Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi blasr , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y autoremove --purge blasr
Referensi
-
situs web blasr
Ringkasan
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal blasr di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.