Cara Menginstal rasmol di Debian 11
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal rasmol di Debian 11. rasmol adalah visualisasi makromolekul biologis
pengantar
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal rasmol di Debian 11.
Apa itu rasmol?
RasMol adalah program grafik molekuler yang ditujukan untuk visualisasi protein, asam nukleat, dan molekul kecil. Program ini ditujukan untuk menampilkan, mengajar, dan menghasilkan gambar berkualitas publikasi. Program membaca dalam file koordinat molekul dan secara interaktif menampilkan molekul di layar dalam berbagai skema warna dan representasi molekul. Representasi yang tersedia saat ini meliputi wireframes dengan isyarat kedalaman, tongkat ‘Dreiding’, bola pengisi ruang angkasa (CPK), bola dan tongkat, pita biomolekul padat dan untai, label atom, dan permukaan titik. Format file input yang didukung termasuk Protein Data Bank (PDB), format Alchemy dan Sybyl Mol2 Tripos Associates, format file Mol Molecular Design Limited (MDL), format XYZ (XMol) Minnesota Supercomputer Center, format CHARMm, format CIF, dan mmCIF memformat file. Paket ini menginstal dua versi RasMol, rasmol-gtk memiliki interface user berbasis GTK cararn dan rasmol-classic adalah versi dengan GUI Xlib lama.
Ada tiga cara untuk menginstal rasmol di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.
Instal rasmol Menggunakan apt-get
Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.
sudo apt-get update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal rasmol menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt-get -y install rasmol
Instal rasmol Menggunakan apt
Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal rasmol menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt -y install rasmol
Instal rasmol Menggunakan aptitude
Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal rasmol menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:
sudo aptitude -y install rasmol
Cara Menghapus Rasmol di Debian 11
Untuk menghapus hanya paket rasmol kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get remove rasmol
Copot pemasangan rasmol Dan Dependensinya
Untuk uninstall rasmol dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:
sudo apt-get -y autoremove rasmol
Hapus Konfigurasi dan Data rasmol
Untuk menghapus konfigurasi rasmol dan data dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y purge rasmol
Hapus konfigurasi rasmol, data, dan semua dependensinya
Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi rasmol , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y autoremove --purge rasmol
Referensi
-
situs rasmol
Ringkasan
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal rasmol di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.