Cara Menginstal Raray di Debian 11

Cara Menginstal Raray di Debian 11

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal Raung di Debian 11. Raungan adalah kecepatan tinggi yang berdiri sendiri pan genome pipeline

pengantar

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstalraray di Debian 11.

Apa itu raung?

Roary adalah pipa pan genome mandiri berkecepatan tinggi, yang mengambil rakitan beranotasi dalam format GFF3 (seperti yang diproduksi, misalnya, oleh Prokka) dan menghitung genom pan. Menggunakan PC desktop standar, ia dapat menganalisis kumpulan data dengan ribuan sampel, sesuatu yang secara komputasi tidak mungkin dilakukan dengan metode yang ada, tanpa mengurangi kualitas hasil. 128 sampel dapat dianalisis dalam waktu kurang dari 1 jam menggunakan 1 GB RAM dan satu prosesor. Untuk melakukan analisis ini menggunakan metode yang ada akan memakan waktu berminggu-minggu dan ratusan GB RAM. Roary tidak dimaksudkan untuk meta-genomik atau untuk membandingkan set genom yang sangat beragam.

Ada tiga cara untuk menginstalraray di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.

Instal Raray Menggunakan apt-get

Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.

sudo apt-get update

Setelah memperbarui basis data apt, Kita dapat menginstal raung menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt-get -y install gemuruh

Instal Raray Menggunakan apt

Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah mengupdate database apt, kita dapat menginstall thundery menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt -y install gemuruh

Instal Raung Menggunakan aptitude

Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui basis data apt, Kita dapat menginstal raung menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:

sudo aptitude -y install gemuruh

Cara Menghapus Raungan di Debian 11

Untuk meng-uninstall hanya paket screamy kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get remove raungan

Copot pemasangan screamy Dan Dependensinya

Untuk meng-uninstall Raray dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:

sudo apt-get -y autoremove raungan

Hapus Konfigurasi dan Data yang meraung

Untuk menghapus konfigurasi dan data raungan dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y purge raungan

Hapus konfigurasi, data, dan semua dependensinya

Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y autoremove --purge raungan

Referensi

  • situs web gemuruh

Ringkasan

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstalraray di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.