Cara Menginstal perm di Debian 11
Dalam tutorial ini kita belajar bagaimana menginstal perm pada Debian 11. perm adalah pemetaan yang efisien dari pembacaan pendek dengan seed spasi periodik
pengantar
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal perm di Debian 11.
Apa itu perm
PerM adalah paket perangkat lunak yang dirancang untuk melakukan penyelarasan skala genom yang sangat efisien untuk ratusan juta pembacaan singkat yang dihasilkan oleh platform pengurutan ABI SOLID dan Illumina. Hari ini PerM mampu memberikan sensitivitas penuh untuk penyelarasan dalam 4 ketidakcocokan untuk pembacaan SOLID 50bp dan 9 ketidakcocokan untuk pembacaan Illumina 100bp.
Ada tiga cara untuk menginstal perm di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.
Instal perm Menggunakan apt-get
Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.
sudo apt-get update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal perm menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt-get -y install perm
Instal perm Menggunakan apt
Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal perm menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt -y install perm
Instal perm Menggunakan aptitude
Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal perm menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:
sudo aptitude -y install perm
Cara Menghapus Perm di Debian 11
Untuk menghapus hanya paket perm kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get remove perm
Copot pemasangan perm Dan Dependensinya
Untuk meng-uninstall perm dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:
sudo apt-get -y autoremove perm
Hapus Konfigurasi dan Data perm
Untuk menghapus konfigurasi perm dan data dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y purge perm
Hapus konfigurasi perm, data, dan semua dependensinya
Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi perm , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y autoremove --purge perm
Referensi
-
situs web perm
Ringkasan
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal perm pada Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.
