Cara Menginstal perm di Debian 11

Cara Menginstal perm di Debian 11

Dalam tutorial ini kita belajar bagaimana menginstal perm pada Debian 11. perm adalah pemetaan yang efisien dari pembacaan pendek dengan seed spasi periodik

pengantar

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal perm di Debian 11.

Apa itu perm

PerM adalah paket perangkat lunak yang dirancang untuk melakukan penyelarasan skala genom yang sangat efisien untuk ratusan juta pembacaan singkat yang dihasilkan oleh platform pengurutan ABI SOLID dan Illumina. Hari ini PerM mampu memberikan sensitivitas penuh untuk penyelarasan dalam 4 ketidakcocokan untuk pembacaan SOLID 50bp dan 9 ketidakcocokan untuk pembacaan Illumina 100bp.

Ada tiga cara untuk menginstal perm di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.

Instal perm Menggunakan apt-get

Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.

sudo apt-get update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal perm menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt-get -y install perm

Instal perm Menggunakan apt

Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal perm menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt -y install perm

Instal perm Menggunakan aptitude

Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal perm menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:

sudo aptitude -y install perm

Cara Menghapus Perm di Debian 11

Untuk menghapus hanya paket perm kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get remove perm

Copot pemasangan perm Dan Dependensinya

Untuk meng-uninstall perm dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:

sudo apt-get -y autoremove perm

Hapus Konfigurasi dan Data perm

Untuk menghapus konfigurasi perm dan data dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y purge perm

Hapus konfigurasi perm, data, dan semua dependensinya

Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi perm , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y autoremove --purge perm

Referensi

  • situs web perm

Ringkasan

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal perm pada Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.