Cara Menginstal paleomix di Debian 11

Cara Menginstal paleomix di Debian 11

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal paleomix di Debian 11. paleomix adalah pipeline dan tools untuk pengolahan data HTS kuno dan cararn

pengantar

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal paleomix di Debian 11.

Apa itu paleomix?

Pipeline PALEOMIX adalah sekumpulan pipeline dan alat yang dirancang untuk membantu pemrosesan cepat data High-Throughput Sequencing (HTS): Pipa BAM memproses pembacaan de-multiplexed dari satu atau lebih sampel, melalui pemrosesan urutan dan penyelarasan, untuk menghasilkan penyelarasan BAM file yang berguna dalam analisis hilir; pipa Filogenetik melakukan inferensi genotipe dan filogenetik pada file penyelarasan BAM, baik yang diproduksi menggunakan pipa BAM atau dihasilkan di tempat lain; dan jalur pipa Zonkey melakukan serangkaian analisis pada penjajaran kuda dengan cakupan rendah, untuk mendeteksi keberadaan hibrida-F1 dalam kumpulan arkeologi. Selain itu, PALEOMIX membantu dalam analisis metagenomik dari ekstrak. Pipeline telah dirancang dengan mempertimbangkan DNA purba (aDNA), dan mencakup beberapa fitur yang sangat berguna untuk analisis sampel kuno, tetapi semuanya dapat digunakan untuk pemrosesan sampel cararn, guna memastikan pemrosesan data yang konsisten.

Ada tiga cara untuk menginstal paleomix di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.

Instal paleomix Menggunakan apt-get

Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.

sudo apt-get update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal paleomix menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt-get -y install paleomix

Instal paleomix Menggunakan apt

Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal paleomix menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt -y install paleomix

Instal paleomix Menggunakan aptitude

Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal paleomix menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:

sudo aptitude -y install paleomix

Cara Menghapus Paleomix di Debian 11

Untuk menghapus hanya paket paleomix kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get remove paleomix

Hapus instalan paleomix Dan Dependensinya

Untuk meng-uninstall paleomix dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:

sudo apt-get -y autoremove paleomix

Hapus Konfigurasi dan Data paleomix

Untuk menghapus konfigurasi paleomix dan data dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y purge paleomix

Hapus konfigurasi paleomix, data, dan semua dependensinya

Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi paleomix , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y autoremove --purge paleomix

Referensi

  • situs paleomix

Ringkasan

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal paleomix di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.