Cara Menginstal nanosv di Debian 11
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal nanosv di Debian 11. nanosv adalah pemanggil varian struktural untuk data nanopore
pengantar
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal nanosv di Debian 11.
Apa itu nanosv
NanoSV adalah paket perangkat lunak yang dapat digunakan untuk mengidentifikasi variasi genomik struktural dalam data sekuensing yang dibaca lama, seperti data yang dihasilkan oleh Oxford Nanopore Technologies?? Instrumen MinION, GridION atau PromethION, atau Pacific Biosciences RSII atau Sequel sequencer. NanoSV telah diuji secara ekstensif menggunakan data sekuensing Oxford Nanopore MinION.
Ada tiga cara untuk menginstal nanosv di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.
Instal nanosv Menggunakan apt-get
Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.
sudo apt-get update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal nanosv menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt-get -y install nanosv
Instal nanosv Menggunakan apt
Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal nanosv menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt -y install nanosv
Instal nanosv Menggunakan aptitude
Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal nanosv menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:
sudo aptitude -y install nanosv
Cara Menghapus nanosv di Debian 11
Untuk menghapus hanya paket nanosv kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get remove nanosv
Copot pemasangan nanosv Dan Dependensinya
Untuk meng-uninstall nanosv dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:
sudo apt-get -y autoremove nanosv
Hapus Konfigurasi dan Data nanosv
Untuk menghapus konfigurasi dan data nanosv dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y purge nanosv
Hapus konfigurasi nanosv, data, dan semua dependensinya
Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi nanosv , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y autoremove --purge nanosv
Referensi
-
situs web nanosv
Ringkasan
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal nanosv di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.
