Cara Menginstal nanosv di Debian 11

Cara Menginstal nanosv di Debian 11

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal nanosv di Debian 11. nanosv adalah pemanggil varian struktural untuk data nanopore

pengantar

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal nanosv di Debian 11.

Apa itu nanosv

NanoSV adalah paket perangkat lunak yang dapat digunakan untuk mengidentifikasi variasi genomik struktural dalam data sekuensing yang dibaca lama, seperti data yang dihasilkan oleh Oxford Nanopore Technologies?? Instrumen MinION, GridION atau PromethION, atau Pacific Biosciences RSII atau Sequel sequencer. NanoSV telah diuji secara ekstensif menggunakan data sekuensing Oxford Nanopore MinION.

Ada tiga cara untuk menginstal nanosv di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.

Instal nanosv Menggunakan apt-get

Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.

sudo apt-get update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal nanosv menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt-get -y install nanosv

Instal nanosv Menggunakan apt

Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal nanosv menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt -y install nanosv

Instal nanosv Menggunakan aptitude

Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal nanosv menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:

sudo aptitude -y install nanosv

Cara Menghapus nanosv di Debian 11

Untuk menghapus hanya paket nanosv kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get remove nanosv

Copot pemasangan nanosv Dan Dependensinya

Untuk meng-uninstall nanosv dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:

sudo apt-get -y autoremove nanosv

Hapus Konfigurasi dan Data nanosv

Untuk menghapus konfigurasi dan data nanosv dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y purge nanosv

Hapus konfigurasi nanosv, data, dan semua dependensinya

Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi nanosv , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y autoremove --purge nanosv

Referensi

  • situs web nanosv

Ringkasan

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal nanosv di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.