Cara Menginstal jaligner di Debian 11

Cara Menginstal jaligner di Debian 11

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal jaligner di Debian 11. jaligner adalah algoritma Smith-Waterman dengan peningkatan Gotohs

pengantar

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal jaligner di Debian 11.

Apa itu jaligner?

JAligner adalah implementasi Java open source dari algoritma Smith-Waterman dengan peningkatan Gotoh untuk penyelarasan urutan berpasangan lokal biologis dengan caral penalti celah affine.

Ada tiga cara untuk menginstal jaligner di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.

Instal jaligner Menggunakan apt-get

Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.

sudo apt-get update

Setelah memperbarui database apt, kita dapat menginstal jaligner menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt-get -y install jaligner

Instal jaligner Menggunakan apt

Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, kita dapat menginstal jaligner menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt -y install jaligner

Instal jaligner Menggunakan aptitude

Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, kita dapat menginstal jaligner menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:

sudo aptitude -y install jaligner

Cara Menghapus Jaligner di Debian 11

Untuk meng-uninstall hanya paket jaligner kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get remove jaligner

Copot pemasangan jaligner Dan Dependensinya

Untuk uninstall jaligner dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:

sudo apt-get -y autoremove jaligner

Hapus Konfigurasi dan Data jaligner

Untuk menghapus konfigurasi dan data jaligner dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y purge jaligner

Hapus konfigurasi jaligner, data, dan semua dependensinya

Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi jaligner , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y autoremove --purge jaligner

Referensi

  • situs web jaligner

Ringkasan

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal jaligner di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.