Cara Menginstal jaligner di Debian 11
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal jaligner di Debian 11. jaligner adalah algoritma Smith-Waterman dengan peningkatan Gotohs
pengantar
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal jaligner di Debian 11.
Apa itu jaligner?
JAligner adalah implementasi Java open source dari algoritma Smith-Waterman dengan peningkatan Gotoh untuk penyelarasan urutan berpasangan lokal biologis dengan caral penalti celah affine.
Ada tiga cara untuk menginstal jaligner di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.
Instal jaligner Menggunakan apt-get
Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.
sudo apt-get update
Setelah memperbarui database apt, kita dapat menginstal jaligner menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt-get -y install jaligner
Instal jaligner Menggunakan apt
Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, kita dapat menginstal jaligner menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt -y install jaligner
Instal jaligner Menggunakan aptitude
Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, kita dapat menginstal jaligner menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:
sudo aptitude -y install jaligner
Cara Menghapus Jaligner di Debian 11
Untuk meng-uninstall hanya paket jaligner kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get remove jaligner
Copot pemasangan jaligner Dan Dependensinya
Untuk uninstall jaligner dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:
sudo apt-get -y autoremove jaligner
Hapus Konfigurasi dan Data jaligner
Untuk menghapus konfigurasi dan data jaligner dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y purge jaligner
Hapus konfigurasi jaligner, data, dan semua dependensinya
Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi jaligner , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y autoremove --purge jaligner
Referensi
-
situs web jaligner
Ringkasan
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal jaligner di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.
