Cara Menginstal exonerate di Debian 11

Cara Menginstal exonerate di Debian 11

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal exonerate di Debian 11. exonerate adalah alat umum untuk perbandingan urutan berpasangan

pengantar

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal exonerate di Debian 11.

Apa itu eksonerasi?

Exonerate memungkinkan Anda untuk menyelaraskan urutan menggunakan banyak caral penyelarasan, baik menggunakan pemrograman dinamis lengkap, atau berbagai heuristik. Banyak fungsi dari rangkaian pemrograman dinamis Wise diimplementasikan kembali dalam C untuk efisiensi yang lebih baik. Exonerate adalah komponen intrinsik dari pembangunan database genom Ensembl, memberikan skor kesamaan antara RNA dan urutan DNA dan dengan demikian menentukan varian sambatan dan urutan pengkodean secara umum. Sistem Simulasi Eksperimen PCR In-silico (lihat halaman manual ipcress) dikemas dengan exonerate. Paket ini juga dilengkapi dengan pilihan utilitas untuk melakukan manipulasi sederhana dengan cepat pada file fasta di luar 2Gb

Ada tiga cara untuk menginstal exonerate di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.

Instal exonerate Menggunakan apt-get

Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.

sudo apt-get update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal exonerate menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt-get -y install exonerate

Instal exonerate Menggunakan apt

Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal exonerate menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt -y install exonerate

Instal exonerate Menggunakan aptitude

Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal exonerate menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:

sudo aptitude -y install exonerate

Cara Uninstall exonerate di Debian 11

Untuk menghapus hanya paket exonerate kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get remove exonerate

Copot pemasangan exonerate Dan Dependensinya

Untuk meng-uninstall exonerate dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:

sudo apt-get -y autoremove exonerate

Hapus Konfigurasi dan Data yang dibebaskan

Untuk menghapus konfigurasi dan data exonerate dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y purge exonerate

Hapus konfigurasi bebas, data, dan semua dependensinya

Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi exonerate , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y autoremove --purge exonerate

Referensi

  • membebaskan situs web

Ringkasan

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal exonerate di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.