Cara Menginstal clustalw di Debian 11
Dalam tutorial ini kita belajar bagaimana menginstal clustalw di Debian 11. clustalw adalah global multiple nucleotide atau peptide alignment alignment
pengantar
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal clustalw di Debian 11.
Apa itu clustalw
Program ini melakukan penyelarasan beberapa nukleotida atau urutan asam amino. Ini mengenali format urutan input dan apakah urutannya adalah asam nukleat (DNA/RNA) atau asam amino (protein). Format output dapat dipilih dari berbagai format untuk beberapa penyelarasan seperti Phylip atau FASTA. Cluster?W diterima dengan sangat baik. Keluaran dari Clustal?W dapat diedit secara manual tetapi lebih disukai dengan editor penyelarasan seperti SeaView atau dalam Clustal?X pendampingnya. Saat membangun caral dari penyelarasan Anda, ini dapat diterapkan untuk pencarian database yang lebih baik. Paket Debian hmmer membuatnya dalam bentuk HMM.
Ada tiga cara untuk menginstal clustalw di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.
Instal clustalw Menggunakan apt-get
Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.
sudo apt-get update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal clustalw menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt-get -y install clustalw
Instal clustalw Menggunakan apt
Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal clustalw menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt -y install clustalw
Instal clustalw Menggunakan aptitude
Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal clustalw menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:
sudo aptitude -y install clustalw
Cara Uninstall clustalw di Debian 11
Untuk menghapus hanya paket clustalw kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get remove clustalw
Copot pemasangan clustalw Dan Dependensinya
Untuk meng-uninstall clustalw dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:
sudo apt-get -y autoremove clustalw
Hapus Konfigurasi dan Data clustalw
Untuk menghapus konfigurasi dan data clustalw dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y purge clustalw
Hapus konfigurasi clustalw, data, dan semua dependensinya
Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi clustalw , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y autoremove --purge clustalw
Referensi
-
situs web clustalw
Ringkasan
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal clustalw di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.
