Cara Menginstal clustalw di Debian 11

Cara Menginstal clustalw di Debian 11

Dalam tutorial ini kita belajar bagaimana menginstal clustalw di Debian 11. clustalw adalah global multiple nucleotide atau peptide alignment alignment

pengantar

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal clustalw di Debian 11.

Apa itu clustalw

Program ini melakukan penyelarasan beberapa nukleotida atau urutan asam amino. Ini mengenali format urutan input dan apakah urutannya adalah asam nukleat (DNA/RNA) atau asam amino (protein). Format output dapat dipilih dari berbagai format untuk beberapa penyelarasan seperti Phylip atau FASTA. Cluster?W diterima dengan sangat baik. Keluaran dari Clustal?W dapat diedit secara manual tetapi lebih disukai dengan editor penyelarasan seperti SeaView atau dalam Clustal?X pendampingnya. Saat membangun caral dari penyelarasan Anda, ini dapat diterapkan untuk pencarian database yang lebih baik. Paket Debian hmmer membuatnya dalam bentuk HMM.

Ada tiga cara untuk menginstal clustalw di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.

Instal clustalw Menggunakan apt-get

Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.

sudo apt-get update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal clustalw menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt-get -y install clustalw

Instal clustalw Menggunakan apt

Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal clustalw menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt -y install clustalw

Instal clustalw Menggunakan aptitude

Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal clustalw menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:

sudo aptitude -y install clustalw

Cara Uninstall clustalw di Debian 11

Untuk menghapus hanya paket clustalw kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get remove clustalw

Copot pemasangan clustalw Dan Dependensinya

Untuk meng-uninstall clustalw dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:

sudo apt-get -y autoremove clustalw

Hapus Konfigurasi dan Data clustalw

Untuk menghapus konfigurasi dan data clustalw dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y purge clustalw

Hapus konfigurasi clustalw, data, dan semua dependensinya

Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi clustalw , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y autoremove --purge clustalw

Referensi

  • situs web clustalw

Ringkasan

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal clustalw di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.