Cara Menginstal busco di Debian 11
Dalam tutorial ini kita belajar bagaimana menginstal busco di Debian 11. busco adalah benchmarking set universal single-copy orthologs
pengantar
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal busco di Debian 11.
Apa itu busco
Menilai perakitan genom dan kelengkapan anotasi dengan Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs (BUSCO)..
- Seleksi otomatis garis keturunan dikeluarkan dari https://www.orthodb.org/
- Pengdownloadan otomatis semua file dan kumpulan data yang diperlukan untuk menjalankan proses
- Gunakan yang hilang untuk genom non-eukariotik
Ada tiga cara untuk menginstal busco di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get , apt dan aptitude . Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.
Instal busco Menggunakan apt-get
Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.
sudo apt-get update
Setelah memperbarui database apt, kita dapat menginstal busco menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt-get -y install busco
Instal busco Menggunakan apt
Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal busco menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt -y install busco
Instal busco Menggunakan aptitude
Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal busco menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:
sudo aptitude -y install busco
Cara Uninstall busco di Debian 11
Untuk meng-uninstall hanya paket busco kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get remove busco
Copot pemasangan busco Dan Dependensinya
Untuk uninstall busco dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:
sudo apt-get -y autoremove busco
Hapus Konfigurasi dan Data busco
Untuk menghapus konfigurasi dan data busco dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y purge busco
Hapus konfigurasi busco, data, dan semua dependensinya
Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi busco , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y autoremove --purge busco
Referensi
- situs web busco
Ringkasan
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal busco di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.