Cara Menginstal busco di Debian 11

Cara Menginstal busco di Debian 11

Dalam tutorial ini kita belajar bagaimana menginstal busco di Debian 11. busco adalah benchmarking set universal single-copy orthologs

pengantar

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal busco di Debian 11.

Apa itu busco

Menilai perakitan genom dan kelengkapan anotasi dengan Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs (BUSCO)..

  • Seleksi otomatis garis keturunan dikeluarkan dari https://www.orthodb.org/
  • Pengdownloadan otomatis semua file dan kumpulan data yang diperlukan untuk menjalankan proses
  • Gunakan yang hilang untuk genom non-eukariotik

Ada tiga cara untuk menginstal busco di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get , apt dan aptitude . Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.

Instal busco Menggunakan apt-get

Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.

sudo apt-get update

Setelah memperbarui database apt, kita dapat menginstal busco menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt-get -y install busco

Instal busco Menggunakan apt

Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal busco menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt -y install busco

Instal busco Menggunakan aptitude

Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal busco menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:

sudo aptitude -y install busco

Cara Uninstall busco di Debian 11

Untuk meng-uninstall hanya paket busco kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get remove busco

Copot pemasangan busco Dan Dependensinya

Untuk uninstall busco dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:

sudo apt-get -y autoremove busco

Hapus Konfigurasi dan Data busco

Untuk menghapus konfigurasi dan data busco dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y purge busco

Hapus konfigurasi busco, data, dan semua dependensinya

Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi busco , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y autoremove --purge busco

Referensi

  • situs web busco

Ringkasan

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal busco di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.

Author: fungsi