Cara Menginstal biosyntax di Debian 11
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal biosyntax di Debian 11. biosyntax adalah Syntax Highlighting for Computational Biology (metapackage)
pengantar
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal biosyntax di Debian 11.
Apa itu biosintaks?
Penyorotan sintaks untuk biologi komputasi untuk mendekatkan Anda secara intuitif dengan data Anda. BioSyntax mendukung file.sam,.flagstat,.vcf,.fasta,.fastq,.faidx,.clustal,.pdb,.gtf,.bed & lainnya.. Ini adalah metapackage tergantung pada semua plugin bioSyntax.
Ada tiga cara untuk menginstal biosyntax di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.
Instal biosyntax Menggunakan apt-get
Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.
sudo apt-get update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal biosyntax menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt-get -y install biosyntax
Instal biosyntax Menggunakan apt
Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal biosyntax menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt -y install biosyntax
Instal biosyntax Menggunakan aptitude
Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal biosyntax menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:
sudo aptitude -y install biosyntax
Cara Uninstall biosyntax di Debian 11
Untuk meng-uninstall hanya paket biosyntax kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get remove biosintaks
Copot pemasangan biosyntax Dan Dependensinya
Untuk meng-uninstall biosyntax dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:
sudo apt-get -y autoremove biosyntax
Hapus Konfigurasi dan Data biosyntax
Untuk menghapus konfigurasi dan data biosyntax dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y purge biosyntax
Hapus konfigurasi biosyntax, data, dan semua dependensinya
Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi biosyntax , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y autoremove --purge biosyntax
Referensi
-
situs web biosintaks
Ringkasan
Dalam tutorial ini kita belajar bagaimana menginstal biosyntax pada Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.