Cara Menginstal bioperl di Debian 11


Cara Menginstal bioperl di Debian 11

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal bioperl di Debian 11. bioperl adalah alat Perl untuk biologi molekuler komputasi

pengantar

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal bioperl di Debian 11.

Apa itu bioperl?

Proyek Bioperl adalah upaya terkoordinasi untuk mengumpulkan metode komputasi yang secara rutin digunakan dalam bioinformatika ke dalam satu set modul Perl gaya CPAN standar, terdokumentasi dengan baik, dan tersedia secara bebas. Ini diterima dengan baik di seluruh komunitas dan digunakan di banyak proyek terkenal, misalnya Ensembl.. Paket yang direkomendasikan diperlukan untuk menjalankan beberapa binari yang disertakan, untuk penjelasan rinci termasuk modul Perl spesifik, silakan lihat README.Debian.. Paket yang disarankan meningkatkan halaman manual.

Ada tiga cara untuk menginstal bioperl di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.

Instal bioperl Menggunakan apt-get

Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.

sudo apt-get update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal bioperl menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt-get -y install bioperl

Instal bioperl Menggunakan apt

Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal bioperl menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt -y install bioperl

Instal bioperl Menggunakan aptitude

Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal bioperl menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:

sudo aptitude -y install bioperl

Cara Uninstall bioperl di Debian 11

Untuk menguninstall hanya paket bioperl kita bisa menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get remove bioperl

Copot pemasangan bioperl Dan Dependensinya

Untuk meng-uninstall bioperl dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:

sudo apt-get -y autoremove bioperl

Hapus Konfigurasi dan Data bioperl

Untuk menghapus konfigurasi dan data bioperl dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y purge bioperl

Hapus konfigurasi bioperl, data, dan semua dependensinya

Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi bioperl , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y autoremove --purge bioperl

Referensi

  • situs web bioperl

Ringkasan

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal bioperl di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.

Author: Zugul Malakiano