Cara Menginstal bioperl di Debian 11
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal bioperl di Debian 11. bioperl adalah alat Perl untuk biologi molekuler komputasi
pengantar
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal bioperl di Debian 11.
Apa itu bioperl?
Proyek Bioperl adalah upaya terkoordinasi untuk mengumpulkan metode komputasi yang secara rutin digunakan dalam bioinformatika ke dalam satu set modul Perl gaya CPAN standar, terdokumentasi dengan baik, dan tersedia secara bebas. Ini diterima dengan baik di seluruh komunitas dan digunakan di banyak proyek terkenal, misalnya Ensembl.. Paket yang direkomendasikan diperlukan untuk menjalankan beberapa binari yang disertakan, untuk penjelasan rinci termasuk modul Perl spesifik, silakan lihat README.Debian.. Paket yang disarankan meningkatkan halaman manual.
Ada tiga cara untuk menginstal bioperl di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.
Instal bioperl Menggunakan apt-get
Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.
sudo apt-get update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal bioperl menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt-get -y install bioperl
Instal bioperl Menggunakan apt
Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal bioperl menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt -y install bioperl
Instal bioperl Menggunakan aptitude
Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal bioperl menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:
sudo aptitude -y install bioperl
Cara Uninstall bioperl di Debian 11
Untuk menguninstall hanya paket bioperl kita bisa menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get remove bioperl
Copot pemasangan bioperl Dan Dependensinya
Untuk meng-uninstall bioperl dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:
sudo apt-get -y autoremove bioperl
Hapus Konfigurasi dan Data bioperl
Untuk menghapus konfigurasi dan data bioperl dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y purge bioperl
Hapus konfigurasi bioperl, data, dan semua dependensinya
Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi bioperl , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y autoremove --purge bioperl
Referensi
-
situs web bioperl
Ringkasan
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal bioperl di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.