Cara Menginstal atac di Debian 11

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal atac di Debian 11. atac adalah perbandingan perakitan-ke-rakitan genom

pengantar

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal atac di Debian 11.

Apa itu atac

atac menghitung penyelarasan berpasangan satu-ke-satu dari sekuens DNA besar. Ini pertama-tama menemukan k-mer unik di setiap urutan, mengikatnya ke blok yang lebih besar, dan mengisi ruang di antara blok. Itu ditulis terutama untuk mentransfer anotasi antara kumpulan genom manusia yang berbeda.. Outputnya adalah satu set ‘pertandingan’ yang tidak memiliki celah, dan satu set ‘jalanan’ dengan celah yang terbentuk dari kecocokan tersebut. Setiap pertandingan atau lari mengaitkan satu urutan dengan urutan lainnya. Asosiasi itu ‘unik’, karena tidak ada asosiasi lain (yang cukup besar) untuk urutan mana pun. Dengan demikian, pengulangan dan duplikasi besar tidak ada dalam output – mereka muncul sebagai wilayah yang tidak dipetakan.. Meskipun output selalu berpasangan, atac dapat menyimpan hasil antara untuk mempercepat perbandingan beberapa urutan.. Paket ini merupakan bagian dari Kmer suite.

Ada tiga cara untuk menginstal atac di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.

Instal atac Menggunakan apt-get

Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.

sudo apt-get update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal atac menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt-get -y install atac

Instal atac Menggunakan apt

Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal atac menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt -y install atac

Instal atac Menggunakan aptitude

Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal atac menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:

sudo aptitude -y install atac

Cara Menghapus instalan atac di Debian 11

Untuk menghapus hanya paket atac kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get remove atac

Copot pemasangan atac Dan Dependensinya

Untuk menguninstall atac dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:

sudo apt-get -y autoremove atac

Hapus Konfigurasi dan Data atac

Untuk menghapus konfigurasi dan data atac dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y purge atac

Hapus konfigurasi atac, data, dan semua dependensinya

Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi atac , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y autoremove --purge atac

Referensi

situs web atac

Ringkasan

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal atac di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.