Cara Menginstal arden di Debian 11
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal arden di Debian 11. arden adalah kontrol spesifisitas untuk membaca perataan menggunakan referensi buatan
pengantar
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal arden di Debian 11.
Apa itu arden?
ARDEN (Artificial Reference Driven Estimation of false positives in NGS data) adalah tolok ukur baru yang memperkirakan tingkat error berdasarkan pembacaan eksperimental nyata dan genom referensi buatan tambahan yang dihasilkan. Hal ini memungkinkan perhitungan tingkat error khusus untuk dataset dan pembangunan kurva ROC. Dengan demikian, dapat digunakan untuk mengoptimalkan parameter untuk read mappers, untuk memilih read mappers untuk masalah tertentu atau juga untuk memfilter alignment berdasarkan estimasi kualitas.
Ada tiga cara untuk menginstal arden di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.
Instal arden Menggunakan apt-get
Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.
sudo apt-get update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal arden menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt-get -y install arden
Instal arden Menggunakan apt
Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal arden menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt -y install arden
Instal arden Menggunakan aptitude
Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal arden menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:
sudo aptitude -y install arden
Cara Uninstall arden di Debian 11
Untuk menghapus hanya paket arden kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get remove arden
Copot pemasangan arden Dan Dependensinya
Untuk meng-uninstall arden dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:
sudo apt-get -y autoremove arden
Hapus Konfigurasi dan Data arden
Untuk menghapus konfigurasi dan data arden dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y purge arden
Hapus konfigurasi arden, data, dan semua dependensinya
Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi arden , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y autoremove --purge arden
Referensi
-
situs web arden
Ringkasan
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal arden di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.
