Cara Memasang cct di Debian 11

Cara Memasang cct di Debian 11

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal cct di Debian 11. cct secara visual membandingkan urutan bakteri, plasmid, kloroplas, atau mitokondria

pengantar

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal cct di Debian 11.

Apa itu cct

CGView Comparison Tool (CCT) adalah paket untuk membandingkan secara visual sekuens bakteri, plasmid, kloroplas, atau mitokondria yang diminati dengan genom atau koleksi sekuens yang ada. Perbandingan dilakukan dengan menggunakan BLAST, dan hasil BLAST disajikan dalam bentuk peta grafis yang juga dapat menunjukkan fitur urutan, nama gen dan protein, penetapan kategori COG, dan karakteristik komposisi urutan. CCT dapat menghasilkan peta dalam berbagai ukuran, termasuk peta 400 Megapiksel yang cocok untuk poster. Perbandingan dapat dilakukan dalam spesies atau genus tertentu, atau semua genom yang tersedia dapat digunakan. Seluruh proses pembuatan peta, mulai dari mengdownload urutan hingga menggambar ulang peta yang diperbesar, dapat diselesaikan dengan mudah menggunakan skrip yang disertakan dengan CCT. Fitur yang ditentukan user atau hasil analisis dapat disertakan pada peta, dan peta dapat disesuaikan secara ekstensif. Untuk menyederhanakan pengaturan program, tersedia engine virtual CCT yang mencakup semua dependensi yang telah diinstal sebelumnya. Tutorial rinci yang menggambarkan useran CCT disertakan dengan dokumentasi CCT.

Ada tiga cara untuk menginstal cct di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.

Instal cct Menggunakan apt-get

Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.

sudo apt-get update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal cct menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt-get -y install cct

Instal cct Menggunakan apt

Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal cct menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt -y install cct

Instal cct Menggunakan aptitude

Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal cct menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:

sudo aptitude -y install cct

Cara Menghapus cct di Debian 11

Untuk menghapus hanya paket cct kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get remove cct

Copot pemasangan cct Dan Dependensinya

Untuk meng-uninstall cct dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:

sudo apt-get -y autoremove cct

Hapus Konfigurasi dan Data cct

Untuk menghapus konfigurasi cct dan data dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y purge cct

Hapus konfigurasi cct, data, dan semua dependensinya

Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi cct , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y autoremove --purge cct

Referensi

  • situs web cct

Ringkasan

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal cct di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.

Related Posts