Cara Install gasic di Debian 11
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal gasic di Debian 11. gasic adalah koreksi kesamaan kelimpahan genom
pengantar
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal gasic di Debian 11.
Apa itu gasic?
Salah satu tujuan analisis metagenomik berbasis sekuensing adalah penilaian taksonomi kuantitatif komposisi komunitas mikroba. Namun, sebagian besar pendekatan baik mengukur pada resolusi rendah (misalnya pada tingkat filum) atau memiliki masalah berat membedakan spesies yang sangat mirip. Namun, kuantifikasi akurat pada tingkat spesies diinginkan dalam aplikasi seperti diagnostik metagenomik atau perbandingan komunitas. GASiC adalah metode untuk mengoreksi hasil penyelarasan baca untuk ambiguitas yang disebabkan oleh kesamaan genom. Ini memiliki kinerja yang unggul atas metode yang ada.
Ada tiga cara untuk menginstal gasic di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.
Instal gasic Menggunakan apt-get
Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.
sudo apt-get update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal gasic menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt-get -y install gasic
Instal gasic Menggunakan apt
Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal gasic menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt -y install gasic
Instal gasic Menggunakan aptitude
Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal gasic menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:
sudo aptitude -y install gasic
Cara Menghapus Gasic di Debian 11
Untuk menghapus hanya paket gasic kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get remove gasic
Copot pemasangan gasic Dan Dependensinya
Untuk meng-uninstall gasic dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:
sudo apt-get -y autoremove gasic
Hapus Konfigurasi dan Data gas
Untuk menghapus konfigurasi gasic dan data dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y purge gasic
Hapus konfigurasi gasic, data, dan semua dependensinya
Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi gasic , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y autoremove --purge gasic
Referensi
-
situs web gasic
Ringkasan
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal gasic di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.