Cara Install gasic di Debian 11

Cara Install gasic di Debian 11

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal gasic di Debian 11. gasic adalah koreksi kesamaan kelimpahan genom

pengantar

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal gasic di Debian 11.

Apa itu gasic?

Salah satu tujuan analisis metagenomik berbasis sekuensing adalah penilaian taksonomi kuantitatif komposisi komunitas mikroba. Namun, sebagian besar pendekatan baik mengukur pada resolusi rendah (misalnya pada tingkat filum) atau memiliki masalah berat membedakan spesies yang sangat mirip. Namun, kuantifikasi akurat pada tingkat spesies diinginkan dalam aplikasi seperti diagnostik metagenomik atau perbandingan komunitas. GASiC adalah metode untuk mengoreksi hasil penyelarasan baca untuk ambiguitas yang disebabkan oleh kesamaan genom. Ini memiliki kinerja yang unggul atas metode yang ada.

Ada tiga cara untuk menginstal gasic di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.

Instal gasic Menggunakan apt-get

Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.

sudo apt-get update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal gasic menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt-get -y install gasic

Instal gasic Menggunakan apt

Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal gasic menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt -y install gasic

Instal gasic Menggunakan aptitude

Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal gasic menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:

sudo aptitude -y install gasic

Cara Menghapus Gasic di Debian 11

Untuk menghapus hanya paket gasic kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get remove gasic

Copot pemasangan gasic Dan Dependensinya

Untuk meng-uninstall gasic dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:

sudo apt-get -y autoremove gasic

Hapus Konfigurasi dan Data gas

Untuk menghapus konfigurasi gasic dan data dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y purge gasic

Hapus konfigurasi gasic, data, dan semua dependensinya

Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi gasic , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y autoremove --purge gasic

Referensi

  • situs web gasic

Ringkasan

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal gasic di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.

Author: fungsi