Cara Instal openbabel di Debian 11

Cara Instal openbabel di Debian 11

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal openbabel di Debian 11. openbabel adalah utilitas kotak peralatan Kimia (cli)

pengantar

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal openbabel di Debian 11.

Apa itu openbabel?

Open Babel adalah kotak peralatan kimia yang dirancang untuk berbicara dalam banyak bahasa data kimia. Hal ini memungkinkan seseorang untuk mencari, mengubah, menganalisis, atau menyimpan data dari pecaralan molekul, kimia, bahan solid-state, biokimia, atau bidang terkait. Fitur-fiturnya antara lain:.

  • Penambahan dan penghapusan hidrogen

  • Dukungan untuk Mekanika Molekuler

  • Dukungan untuk sintaks pencocokan molekul SMARTS

  • Persepsi fitur otomatis (cincin, ikatan, hibridisasi, aromatik)

  • Jenis atom yang fleksibel dan persepsi ikatan ganda dari koordinat atom

  • Perhitungan muatan parsial Gasteiger-Marsili. Format file yang didukung Open Babel termasuk PDB, XYZ, CIF, CML, SMILES, MDL Molfile, ChemDraw, Gaussian, GAMESS, MOPAC dan MPQC.. Paket ini mencakup utilitas berikut:

  • obabel: Mengkonversi antara berbagai format file kimia

  • obenergy: Hitung energi untuk molekul

  • obminimize: Optimalkan geometri, minimalkan energi untuk molekul

  • obgrep: Program pencarian molekuler menggunakan pola SMARTS

  • obgen: Hasilkan koordinat 3D untuk sebuah molekul

  • obprop: Cetak sifat molekul standar

  • obfit: Melapiskan dua molekul berdasarkan pola

  • obrotamer: Hasilkan koordinat konformer/rotamer

  • obconformer: Hasilkan konformer berenergi rendah

  • obkiral: Cetak informasi kiralitas molekuler

  • obrotate: Putar sudut dihedral molekul dalam cara batch

  • obprobe: Buat grid probe elektrostatik

Ada tiga cara untuk menginstal openbabel di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.

Instal openbabel Menggunakan apt-get

Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.

sudo apt-get update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal openbabel menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt-get -y install openbabel

Instal openbabel Menggunakan apt

Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal openbabel menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt -y install openbabel

Instal openbabel Menggunakan aptitude

Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal openbabel menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:

sudo aptitude -y install openbabel

Cara Uninstall openbabel di Debian 11

Untuk meng-uninstall hanya paket openbabel kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get remove openbabel

Copot pemasangan openbabel Dan Dependensinya

Untuk meng-uninstall openbabel dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:

sudo apt-get -y autoremove openbabel

Hapus Konfigurasi dan Data openbabel

Untuk menghapus konfigurasi dan data openbabel dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y purge openbabel

Hapus konfigurasi openbabel, data, dan semua dependensinya

Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi openbabel , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y autoremove --purge openbabel

Referensi

  • situs openbabel

Ringkasan

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal openbabel di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.

Related Posts