Cara Menginstal primer3 di Debian 11

Dalam tutorial ini kita belajar bagaimana menginstal primer3 pada Debian 11. primer3 adalah alat untuk merancang nukleotida oligo mengapit untuk amplifikasi DNA

pengantar

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal primer3 di Debian 11.

Apa itu primer3

Primer3 memilih primer untuk Reaksi Rantai Polimerase (PCR), dengan mempertimbangkan kriteria suhu leleh oligonukleotida, ukuran, kandungan GC dan kemungkinan primer-dimer, ukuran produk PCR, batasan posisi dalam urutan sumber, dan berbagai batasan lainnya. Semua kriteria ini dapat ditentukan user sebagai kendala, dan beberapa dapat ditentukan sebagai istilah dalam fungsi tujuan yang mencirikan pasangan primer yang optimal.

Ada tiga cara untuk menginstal primer3 di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.

Instal primer3 Menggunakan apt-get

Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.

sudo apt-get update

Setelah memperbarui database apt, kita dapat menginstal primer3 menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt-get -y install primer3

Instal primer3 Menggunakan apt

Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal primer3 menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt -y install primer3

Instal primer3 Menggunakan aptitude

Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal primer3 menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:

sudo aptitude -y install primer3

Cara Menghapus primer3 di Debian 11

Untuk meng-uninstall hanya paket primer3 kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get remove primer3

Copot pemasangan primer3 Dan Dependensinya

Untuk meng-uninstall primer3 dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:

sudo apt-get -y autoremove primer3

Hapus Konfigurasi dan Data primer3

Untuk menghapus konfigurasi dan data primer3 dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y purge primer3

Hapus konfigurasi primer3, data, dan semua dependensinya

Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi primer3 , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y autoremove --purge primer3

Referensi

situs web primer3

Ringkasan

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal primer3 di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.