Cara Menginstal placnet di Debian 11

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal placnet di Debian 11. placnet adalah proyek Jaringan Konstelasi Plasmid

pengantar

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal placnet di Debian 11.

Apa itu plasenta?

Placnet adalah alat baru untuk analisis plasmid dalam proyek NGS. Placnet dioptimalkan untuk bekerja dengan urutan Illumina tetapi juga bekerja dengan 454, Iontorrent atau teknologi urutan yang sebenarnya. Masukan dari placnet adalah satu set contigs dan satu atau lebih file SAM dengan pemetaan pembacaan terhadap contigs. Placnet memperoleh satu set file, mudah dibuka pada perangkat lunak Cytoscape atau alat jaringan lainnya.

Ada tiga cara untuk menginstal placnet di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.

Instal placnet Menggunakan apt-get

Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.

sudo apt-get update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal placnet menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt-get -y install placnet

Instal placnet Menggunakan apt

Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal placnet menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt -y install placnet

Instal placnet Menggunakan aptitude

Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal placnet menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:

sudo aptitude -y install placnet

Cara Menghapus placnet di Debian 11

Untuk meng-uninstall hanya paket placnet kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get remove placnet

Copot pemasangan placnet Dan Dependensinya

Untuk meng-uninstall placnet dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:

sudo apt-get -y autoremove placnet

Hapus Konfigurasi dan Data placnet

Untuk menghapus konfigurasi dan data placnet dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y purge placnet

Hapus konfigurasi placnet, data, dan semua dependensinya

Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi placnet , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y autoremove --purge placnet

Referensi

situs web placenet

Ringkasan

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal placnet di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.