Cara Menginstal ivar di Debian 11

Cara Menginstal ivar di Debian 11

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal ivar di Debian 11. ivar berfungsi secara luas berguna untuk pengurutan berbasis amplikon virus

pengantar

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal ivar di Debian 11.

Apa itu ivar

iVar adalah paket komputasi yang berisi fungsi yang secara luas berguna untuk pengurutan berbasis amplikon virus. Alat tambahan untuk pengurutan metagenomik secara aktif dimasukkan ke dalam iVar. Sementara masing-masing fungsi ini dapat dicapai dengan menggunakan alat yang ada, iVar berisi persimpangan fungsionalitas dari beberapa alat yang diperlukan untuk memanggil iSNV dan urutan konsensus dari data urutan virus di beberapa ulangan. iVar menyediakan fungsi-fungsi berikut:.

  1. pemangkasan primer dan basa berkualitas rendah,

  2. panggilan konsensus,

  3. panggilan varian – baik iSNV dan penyisipan/penghapusan, dan

  4. mengidentifikasi ketidaksesuaian dengan urutan primer dan mengecualikan pembacaan yang sesuai dari file penyelarasan.

Ada tiga cara untuk menginstal ivar di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get , apt dan aptitude . Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.

Instal ivar Menggunakan apt-get

Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.

sudo apt-get update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal ivar menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt-get -y install ivar

Instal ivar Menggunakan apt

Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal ivar menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt -y install ivar

Instal ivar Menggunakan aptitude

Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal ivar menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:

sudo aptitude -y install ivar

Cara Menghapus ivar di Debian 11

Untuk menghapus hanya paket ivar kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get remove ivar

Copot ivar Dan Dependensinya

Untuk meng-uninstall ivar dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:

sudo apt-get -y autoremove ivar

Hapus Konfigurasi dan Data ivar

Untuk menghapus konfigurasi ivar dan data dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y purge ivar

Hapus konfigurasi ivar, data, dan semua dependensinya

Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi ivar , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y autoremove --purge ivar

Referensi

  • situs web ivar

Ringkasan

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal ivar di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.

Author: fungsi