Cara Menginstal gff2ps di Debian 11
Dalam tutorial ini kita belajar bagaimana menginstal gff2ps pada Debian 11. gff2ps menghasilkan output grafis PostScript dari file GFF
pengantar
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal gff2ps di Debian 11.
Apa itu gff2ps
gff2ps adalah program skrip yang dikembangkan dengan tujuan mengubah rekaman berformat gff menjadi plot satu dimensi berkualitas tinggi di PostScript. Plot semacam itu mungkin berguna untuk membandingkan struktur genom dan untuk memvisualisasikan keluaran dari program anotasi genom. Ini dapat digunakan dengan cara yang sangat sederhana, karena mengasumsikan bahwa file GFF itu sendiri membawa informasi pemformatan yang cukup, tetapi juga memungkinkan melalui sejumlah opsi dan/atau file konfigurasi, untuk tingkat penyesuaian yang besar.
Ada tiga cara untuk menginstal gff2ps di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.
Instal gff2ps Menggunakan apt-get
Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.
sudo apt-get update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal gff2ps menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt-get -y install gff2ps
Instal gff2ps Menggunakan apt
Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal gff2ps menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt -y install gff2ps
Instal gff2ps Menggunakan aptitude
Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal gff2ps menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:
sudo aptitude -y install gff2ps
Cara Uninstall gff2ps di Debian 11
Untuk meng-uninstall hanya paket gff2ps kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get remove gff2ps
Copot pemasangan gff2ps Dan Dependensinya
Untuk uninstall gff2ps dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:
sudo apt-get -y autoremove gff2ps
Hapus Konfigurasi dan Data gff2ps
Untuk menghapus konfigurasi dan data gff2ps dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y purge gff2ps
Hapus konfigurasi gff2ps, data, dan semua dependensinya
Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi gff2ps , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y autoremove --purge gff2ps
Referensi
-
situs web gff2ps
Ringkasan
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal gff2ps di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.