Cara Menginstal gff2ps di Debian 11

Cara Menginstal gff2ps di Debian 11

Dalam tutorial ini kita belajar bagaimana menginstal gff2ps pada Debian 11. gff2ps menghasilkan output grafis PostScript dari file GFF

pengantar

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal gff2ps di Debian 11.

Apa itu gff2ps

gff2ps adalah program skrip yang dikembangkan dengan tujuan mengubah rekaman berformat gff menjadi plot satu dimensi berkualitas tinggi di PostScript. Plot semacam itu mungkin berguna untuk membandingkan struktur genom dan untuk memvisualisasikan keluaran dari program anotasi genom. Ini dapat digunakan dengan cara yang sangat sederhana, karena mengasumsikan bahwa file GFF itu sendiri membawa informasi pemformatan yang cukup, tetapi juga memungkinkan melalui sejumlah opsi dan/atau file konfigurasi, untuk tingkat penyesuaian yang besar.

Ada tiga cara untuk menginstal gff2ps di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.

Instal gff2ps Menggunakan apt-get

Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.

sudo apt-get update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal gff2ps menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt-get -y install gff2ps

Instal gff2ps Menggunakan apt

Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal gff2ps menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt -y install gff2ps

Instal gff2ps Menggunakan aptitude

Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal gff2ps menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:

sudo aptitude -y install gff2ps

Cara Uninstall gff2ps di Debian 11

Untuk meng-uninstall hanya paket gff2ps kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get remove gff2ps

Copot pemasangan gff2ps Dan Dependensinya

Untuk uninstall gff2ps dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:

sudo apt-get -y autoremove gff2ps

Hapus Konfigurasi dan Data gff2ps

Untuk menghapus konfigurasi dan data gff2ps dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y purge gff2ps

Hapus konfigurasi gff2ps, data, dan semua dependensinya

Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi gff2ps , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y autoremove --purge gff2ps

Referensi

  • situs web gff2ps

Ringkasan

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal gff2ps di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.

Author: fungsi