Cara Menginstal canu di Debian 11

Cara Menginstal canu di Debian 11

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal canu di Debian 11. canu adalah assembler urutan molekul tunggal untuk genom

pengantar

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal canu di Debian 11.

Apa itu canu?

Canu adalah garpu dari Celera Assembler, dirancang untuk pengurutan molekul tunggal dengan noise tinggi (seperti PacBio RS II atau Oxford Nanopore MinION).. Canu adalah pipa perakitan hierarkis yang berjalan dalam empat langkah:.

  • Deteksi tumpang tindih dalam urutan kebisingan tinggi menggunakan MHAP

  • Hasilkan konsensus urutan yang dikoreksi

  • Pangkas urutan yang dikoreksi

  • Merakit urutan dikoreksi yang dipangkas

Ada tiga cara untuk menginstal canu di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get , apt dan aptitude . Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.

Instal canu Menggunakan apt-get

Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.

sudo apt-get update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal canu menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt-get -y install canu

Instal canu Menggunakan apt

Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal canu menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt -y install canu

Instal canu Menggunakan aptitude

Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal canu menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:

sudo aptitude -y install canu

Cara Menghapus Canu di Debian 11

Untuk menghapus hanya paket canu kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get remove canu

Copot pemasangan canu Dan Dependensinya

Untuk uninstall canu dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:

sudo apt-get -y autoremove canu

Hapus Konfigurasi dan Data canu

Untuk menghapus konfigurasi canu dan data dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y purge canu

Hapus konfigurasi canu, data, dan semua dependensinya

Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi canu , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y autoremove --purge canu

Referensi

  • situs web canu

Ringkasan

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal canu di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.

Author: Zugul Malakiano