Cara Menginstal belvu di Debian 11


Cara Menginstal belvu di Debian 11

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal belvu di Debian 11. belvu adalah penampil penyelarasan urutan berganda dan alat filogenetik

pengantar

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal belvu di Debian 11.

Apa itu belvu

Belvu adalah penampil penyelarasan beberapa urutan dan alat filogenetik dengan serangkaian cara yang dapat dikonfigurasi user untuk residu warna..

  • Lihat beberapa perataan urutan.

  • Residu dapat diwarnai dengan konservasi, dengan potongan dan warna yang dapat dikonfigurasi user.

  • Residu dapat diwarnai berdasarkan jenis residu (dapat dikonfigurasi user).

  • Skema warna dapat diimpor atau diekspor.

  • Entri Swissprot (atau PIR) dapat diambil dengan mengklik dua kali.

  • Posisi dalam keselarasan dapat dengan mudah dilacak.

  • Penghapusan baris dan kolom secara manual.

  • Pengeditan otomatis baris dan kolom berdasarkan kriteria yang dapat disesuaikan:

    • penghapusan kolom semua celah;

    • penghapusan semua celah;

    • penghapusan urutan yang berlebihan;

    • penghapusan kolom dengan persentase celah yang ditentukan user;

    • penyaringan urutan berdasarkan persen identitas;

    • penghapusan urutan dengan persentase celah yang ditentukan user;

    • penghapusan urutan parsial (yang dimulai atau diakhiri dengan celah); dan

    • penghapusan kolom dengan konservasi (dengan cutoff atas/bawah yang ditentukan user).

  • Perataan dapat disimpan dalam format Stockholm, Selex, MSF atau FASTA.

  • Matriks jarak antara urutan dapat dihasilkan menggunakan berbagai metrik jarak.

  • Matriks jarak dapat diimpor atau diekspor.

  • Pohon filogenetik dapat dibangun berdasarkan berbagai algoritma rekonstruksi pohon berbasis jarak.

  • Pohon dapat disimpan dalam format New Hampshire.

  • Belvu dapat melakukan rekonstruksi filogenetik bootstrap.

Ada tiga cara untuk menginstal belvu di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get , apt dan aptitude . Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.

Instal belvu Menggunakan apt-get

Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.

sudo apt-get update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal belvu menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt-get -y install belvu

Instal belvu Menggunakan apt

Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal belvu menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt -y install belvu

Instal belvu Menggunakan aptitude

Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal belvu menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:

sudo aptitude -y install belvu

Cara Menghapus belvu di Debian 11

Untuk menghapus hanya paket belvu kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get remove belvu

Copot belvu Dan Dependensinya

Untuk meng-uninstall belvu dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:

sudo apt-get -y autoremove belvu

Hapus Konfigurasi dan Data belvu

Untuk menghapus konfigurasi dan data belvu dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y purge belvu

Hapus konfigurasi belvu, data, dan semua dependensinya

Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi belvu , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y autoremove --purge belvu

Referensi

  • situs web belvu

Ringkasan

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal belvu di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.

Author: Zugul Malakiano