Cara Menginstal artfastqgenerator di Debian 11
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal artfastqgenerator di Debian 11. artfastqgenerator adalah output file FASTQ buatan yang berasal dari genom referensi
pengantar
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal artfastqgenerator di Debian 11.
Apa itu artfastqgenerator?
ArtificialFastqGenerator mengambil genom referensi (dalam format FASTA) sebagai input dan output file FASTQ buatan dalam format Sanger. Itu dapat menerima skor kualitas dasar Phred dari file FASTQ yang ada, dan menggunakannya untuk mensimulasikan error pengurutan. Karena FASTQ buatan diturunkan dari genom referensi, genom referensi menyediakan standar emas untuk memanggil varian (Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) dan penyisipan dan penghapusan (indels)). Ini memungkinkan evaluasi saluran analisis Next Generation Sequencing (NGS) yang menyelaraskan bacaan dengan genom referensi dan kemudian memanggil varian.
Ada tiga cara untuk menginstal artfastqgenerator di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.
Instal artfastqgenerator Menggunakan apt-get
Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.
sudo apt-get update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal artfastqgenerator menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt-get -y install artfastqgenerator
Instal artfastqgenerator Menggunakan apt
Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal artfastqgenerator menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt -y install artfastqgenerator
Instal artfastqgenerator Menggunakan aptitude
Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal artfastqgenerator menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:
sudo aptitude -y install artfastqgenerator
Cara Menghapus instalan artfastqgenerator di Debian 11
Untuk menghapus hanya paket artfastqgenerator kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get remove artfastqgenerator
Copot pemasangan artfastqgenerator Dan Dependensinya
Untuk menguninstall artfastqgenerator dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:
sudo apt-get -y autoremove artfastqgenerator
Hapus Konfigurasi dan Data artfastqgenerator
Untuk menghapus konfigurasi dan data artfastqgenerator dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y purge artfastqgenerator
Hapus konfigurasi artfastqgenerator, data, dan semua dependensinya
Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi artfastqgenerator, data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y autoremove --purge artfastqgenerator
Referensi
-
situs web artfastqgenerator
Ringkasan
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal artfastqgenerator di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.