Cara Menginstal ariba di Debian 11
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal ariba di Debian 11. ariba adalah Identifikasi Resistensi Antibiotik Dengan Perakitan
pengantar
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal ariba di Debian 11.
Apa itu ariba
ARIBA adalah alat yang mengidentifikasi gen resistensi antibiotik dengan menjalankan perakitan lokal. Inputnya adalah file FASTA dari gen referensi dan pembacaan sekuensing berpasangan. ARIBA melaporkan gen referensi mana yang ditemukan, ditambah informasi terperinci tentang kualitas rakitan dan varian apa pun antara pembacaan sekuensing dan gen referensi.
Ada tiga cara untuk menginstal ariba di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.
Instal ariba Menggunakan apt-get
Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.
sudo apt-get update
Setelah memperbarui database apt, kita dapat menginstal ariba menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt-get -y install ariba
Instal ariba Menggunakan apt
Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal ariba menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt -y install ariba
Instal ariba Menggunakan aptitude
Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal ariba menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:
sudo aptitude -y install ariba
Cara Menghapus instalasi ariba di Debian 11
Untuk menghapus hanya paket ariba kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get remove ariba
Copot pemasangan ariba Dan Dependensinya
Untuk meng-uninstall ariba dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:
sudo apt-get -y autoremove ariba
Hapus Konfigurasi dan Data ariba
Untuk menghapus konfigurasi dan data ariba dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y purge ariba
Hapus konfigurasi ariba, data, dan semua dependensinya
Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi ariba , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y autoremove --purge ariba
Referensi
-
situs web ariba
Ringkasan
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal ariba di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.