Cara Menginstal apbs di Debian 11
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal apbs di Debian 11. apbs adalah Adaptive Poisson Boltzmann Solver
pengantar
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal apbs di Debian 11.
Apa itu apbs
APBS adalah paket perangkat lunak untuk solusi numerik dari persamaan Poisson-Boltzmann (PBE), salah satu caral kontinum paling populer untuk menggambarkan interaksi elektrostatik antara zat terlarut molekul dalam media berair asin. Elektrostatika kontinum memainkan peran penting dalam beberapa bidang simulasi biomolekuler, termasuk:.
-
simulasi proses difusi untuk menentukan kinetika pengikatan ligan-protein dan protein-protein,
-
dinamika molekul pelarut implisit biomolekul,
-
solvasi dan perhitungan energi ikat untuk menentukan konstanta pengikatan keseimbangan ligan-protein dan protein-protein dan membantu dalam desain obat yang rasional,
-
dan studi titrasi biomolekuler.. APBS dirancang untuk mengevaluasi sifat elektrostatik secara efisien untuk simulasi semacam itu untuk rentang skala panjang yang luas guna memungkinkan penyelidikan molekul dengan puluhan hingga jutaan atom.. Paket ini berisi program dan utilitas apbs.
Ada tiga cara untuk menginstal apbs di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get , apt dan aptitude . Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.
Instal apbs Menggunakan apt-get
Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.
sudo apt-get update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal apbs menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt-get -y install apbs
Instal apbs Menggunakan apt
Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal apbs menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:
sudo apt -y install apbs
Instal apbs Menggunakan aptitude
Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.
sudo apt update
Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal apbs menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:
sudo aptitude -y install apbs
Cara Uninstall apbs di Debian 11
Untuk menghapus hanya paket apbs kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get remove apbs
Copot pemasangan apbs Dan Dependensinya
Untuk meng-uninstall apbs dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:
sudo apt-get -y autoremove apbs
Hapus Konfigurasi dan Data apbs
Untuk menghapus konfigurasi dan data apbs dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y purge apbs
Hapus konfigurasi apbs, data, dan semua dependensinya
Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi apbs , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:
sudo apt-get -y autoremove --purge apbs
Referensi
-
situs web apbs
Ringkasan
Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal apbs di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.