Cara Memasang allelecount di Debian 11


Cara Memasang allelecount di Debian 11

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal allelecount di Debian 11. allelecount adalah algoritma nomor copyan NGS

pengantar

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal allelecount di Debian 11.

Apa itu allelecount?

Kode dukungan untuk algoritma nomor copyan NGS. Mengambil file lokasi dan file [cr|b]am dan menghasilkan hitungan cakupan setiap alel [ACGT] di lokasi itu (dengan pengaturan filter apa pun).. Paket alleleCount terutama ada untuk mencegah duplikasi kode antara beberapa proyek lain, khususnya AscatNGS dan Battenberg.

Ada tiga cara untuk menginstal allelecount di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.

Instal allelecount Menggunakan apt-get

Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.

sudo apt-get update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal allelecount menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt-get -y install allelecount

Instal allelecount Menggunakan apt

Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal allelecount menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt -y install allelecount

Instal allelecount Menggunakan aptitude

Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal allelecount menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:

sudo aptitude -y install allelecount

Cara Menghapus allelecount di Debian 11

Untuk menghapus hanya paket allelecount kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get remove allelecount

Copot allelecount Dan Dependensinya

Untuk meng-uninstall allelecount dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:

sudo apt-get -y autoremove allelecount

Hapus Konfigurasi dan Data allelecount

Untuk menghapus konfigurasi dan data allelecount dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y purge allelecount

Hapus konfigurasi allelecount, data, dan semua dependensinya

Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi allelecount , data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y autoremove --purge allelecount

Referensi

  • situs web allelecount

Ringkasan

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal allelecount di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.

Author: Zugul Malakiano