Cara Menginstal ampliconnoise di Debian 11


Cara Menginstal ampliconnoise di Debian 11

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal ampliconnoise pada Debian 11. ampliconnoise adalah penghilangan noise dari 454 amplikon PCR yang diurutkan

pengantar

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal ampliconnoise di Debian 11.

Apa itu ampliconnoise?

AmpliconNoise adalah paket aplikasi untuk membersihkan data urutan throughput tinggi. Ini terdiri dari tiga bagian utama:. Pyronoise – melakukan pengelompokan berbasis flowgram untuk menemukan error pembacaan SeqNoise – menghilangkan mutasi titik PCR Perseus – menghapus chimera PCR tanpa memerlukan serangkaian urutan referensi. Sebelumnya ada “Pyronoise” mandiri oleh penulis yang sama dan paket ini menyertakan versi yang diperbarui. Ada juga “Denoiser” di Qiime yang terkait tetapi berbeda.

Ada tiga cara untuk menginstal ampliconnoise di Debian 11. Kita bisa menggunakan apt-get, apt dan aptitude. Pada bagian berikut kami akan menjelaskan masing-masing metode. Anda dapat memilih salah satunya.

Instal ampliconnoise Menggunakan apt-get

Perbarui database apt dengan apt-get menggunakan perintah berikut.

sudo apt-get update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal ampliconnoise menggunakan apt-get dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt-get -y install ampliconnoise

Instal ampliconnoise Menggunakan apt

Perbarui database apt dengan apt menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal ampliconnoise menggunakan apt dengan menjalankan perintah berikut:

sudo apt -y install ampliconnoise

Instal ampliconnoise Menggunakan aptitude

Jika Anda ingin mengikuti metode ini, Anda mungkin perlu menginstal aptitude terlebih dahulu karena aptitude biasanya tidak diinstal secara default di Debian. Perbarui database apt dengan aptitude menggunakan perintah berikut.

sudo apt update

Setelah memperbarui database apt, Kita dapat menginstal ampliconnoise menggunakan aptitude dengan menjalankan perintah berikut:

sudo aptitude -y install ampliconnoise

Cara Menghapus instalan ampliconnoise di Debian 11

Untuk menghapus hanya paket ampliconnoise kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get remove ampliconnoise

Copot pemasangan ampliconnoise Dan Dependensinya

Untuk uninstall ampliconnoise dan dependensinya yang tidak lagi dibutuhkan oleh Debian 11, kita bisa menggunakan perintah di bawah ini:

sudo apt-get -y autoremove ampliconnoise

Hapus Konfigurasi dan Data ampliconnoise

Untuk menghapus konfigurasi dan data ampliconnoise dari Debian 11 kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y purge ampliconnoise

Hapus konfigurasi ampliconnoise, data, dan semua dependensinya

Kita dapat menggunakan perintah berikut untuk menghapus konfigurasi ampliconnoise, data dan semua dependensinya, kita dapat menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get -y autoremove --purge ampliconnoise

Referensi

  • situs web ampliconnoise

Ringkasan

Dalam tutorial ini kita belajar cara menginstal ampliconnoise di Debian 11 menggunakan alat manajemen paket yang berbeda seperti apt, apt-get dan aptitude.

Author: Zugul Malakiano